Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrcdQ00LT2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrcdQ00LT2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PrcdQ00LT2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms