Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbp4Q00724 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbp4Q00724 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbp4Q00724 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms