Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8a1Q00558 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8a1Q00558 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F8a1Q00558 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms