Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brca2P97929 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brca2P97929 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brca2P97929 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brca2P97929 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms