Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
AlkP97793 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
AlkP97793 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AlkP97793 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
AlkP97793 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
AlkP97793 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
AlkP97793 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
AlkP97793 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AlkP97793 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AlkP97793 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AlkP97793 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
AlkP97793 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AlkP97793 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AlkP97793 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AlkP97793 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
AlkP97793 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AlkP97793 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AlkP97793 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
AlkP97793 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
AlkP97793 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
AlkP97793 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
AlkP97793 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
AlkP97793 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
AlkP97793 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AlkP97793 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AlkP97793 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AlkP97793 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
AlkP97793 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
AlkP97793 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
AlkP97793 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
AlkP97793 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
AlkP97793 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
AlkP97793 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
AlkP97793 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
AlkP97793 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
AlkP97793 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
AlkP97793 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AlkP97793 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AlkP97793 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
AlkP97793 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AlkP97793 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
AlkP97793 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
AlkP97793 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
AlkP97793 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
AlkP97793 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
AlkP97793 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
AlkP97793 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AlkP97793 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AlkP97793 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AlkP97793 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AlkP97793 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AlkP97793 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AlkP97793 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
AlkP97793 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AlkP97793 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
AlkP97793 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AlkP97793 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
AlkP97793 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
AlkP97793 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AlkP97793 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
AlkP97793 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AlkP97793 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AlkP97793 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AlkP97793 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AlkP97793 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AlkP97793 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AlkP97793 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AlkP97793 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AlkP97793 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AlkP97793 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AlkP97793 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AlkP97793 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AlkP97793 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AlkP97793 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AlkP97793 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms