Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarcc1P97496 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcc1P97496 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms