Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata5P97489 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata5P97489 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gata5P97489 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata5P97489 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata5P97489 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms