Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Npas2P97460 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Npas2P97460 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas2P97460 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas2P97460 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Npas2P97460 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas2P97460 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Npas2P97460 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms