Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Npas1P97459 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas1P97459 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Npas1P97459 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Npas1P97459 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms