Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b3P97370 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b3P97370 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms