Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arf1P84078 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf1P84078 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms