Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubg1P83887 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms