Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx1P81068 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx1P81068 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx1P81068 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx1P81068 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx1P81068 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx1P81068 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx1P81068 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx1P81068 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx1P81068 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx1P81068 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irx1P81068 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx1P81068 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx1P81068 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx1P81068 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx1P81068 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx1P81068 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx1P81068 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx1P81068 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx1P81068 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx1P81068 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx1P81068 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx1P81068 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx1P81068 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx1P81068 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx1P81068 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx1P81068 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx1P81068 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx1P81068 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx1P81068 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx1P81068 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx1P81068 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx1P81068 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx1P81068 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx1P81068 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms