Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx2P81066 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irx2P81066 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms