Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf3P70671 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf3P70671 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf3P70671 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf3P70671 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf3P70671 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf3P70671 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms