Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb1P70662 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb1P70662 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldb1P70662 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms