Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Erbb2P70424 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Erbb2P70424 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Erbb2P70424 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms