Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tp53bp1P70399 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tp53bp1P70399 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tp53bp1P70399 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms