Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeboxP70368 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms