Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufd1P70362 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufd1P70362 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms