Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pitx1P70314 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pitx1P70314 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pitx1P70314 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pitx1P70314 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pitx1P70314 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pitx1P70314 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pitx1P70314 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pitx1P70314 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pitx1P70314 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms