Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf6P70279 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf6P70279 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf6P70279 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf6P70279 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf6P70279 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf6P70279 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Surf6P70279 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf6P70279 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms