Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actg1P63260 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actg1P63260 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Actg1P63260 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actg1P63260 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actg1P63260 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actg1P63260 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms