Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps27aP62983 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps27aP62983 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms