Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl30P62889 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl30P62889 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms