Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ElobP62869 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ElobP62869 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ElobP62869 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ElobP62869 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ElobP62869 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ElobP62869 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ElobP62869 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElobP62869 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElobP62869 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElobP62869 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElobP62869 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElobP62869 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElobP62869 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElobP62869 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElobP62869 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElobP62869 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElobP62869 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ElobP62869 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ElobP62869 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ElobP62869 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms