Protein–RNA interactions for Protein: P62827

Ran, GTP-binding nuclear protein Ran, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RanP62827 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RanP62827 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RanP62827 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RanP62827 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RanP62827 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RanP62827 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RanP62827 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RanP62827 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RanP62827 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RanP62827 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RanP62827 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RanP62827 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RanP62827 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RanP62827 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RanP62827 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RanP62827 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RanP62827 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RanP62827 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RanP62827 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RanP62827 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RanP62827 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RanP62827 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RanP62827 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RanP62827 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RanP62827 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RanP62827 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RanP62827 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RanP62827 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RanP62827 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RanP62827 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms