Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmc5P62196 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmc5P62196 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms