Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp46P62069 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp46P62069 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp46P62069 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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