Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psme3P61290 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psme3P61290 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psme3P61290 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Psme3P61290 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psme3P61290 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms