Protein–RNA interactions for Protein: P61237

Ypel3, Protein yippee-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ypel3P61237 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ypel3P61237 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ypel3P61237 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms