Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PlnP61014 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PlnP61014 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PlnP61014 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PlnP61014 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PlnP61014 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PlnP61014 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PlnP61014 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PlnP61014 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PlnP61014 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PlnP61014 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PlnP61014 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PlnP61014 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PlnP61014 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PlnP61014 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PlnP61014 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PlnP61014 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PlnP61014 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PlnP61014 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PlnP61014 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PlnP61014 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PlnP61014 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PlnP61014 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PlnP61014 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PlnP61014 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PlnP61014 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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