Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CirbpP60824 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CirbpP60824 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CirbpP60824 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CirbpP60824 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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