Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfia3P60469 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfia3P60469 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms