Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcbp1P60335 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcbp1P60335 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms