Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcif1P59114 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcif1P59114 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms