Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Csrnp3P59055 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Csrnp3P59055 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Csrnp3P59055 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms