Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdrg1P59048 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdrg1P59048 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms