Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm1P58771 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms