Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc10P56960 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc10P56960 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc10P56960 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc10P56960 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exosc10P56960 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Exosc10P56960 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms