Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdcd5P56812 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd5P56812 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms