Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NcanP55066 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NcanP55066 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NcanP55066 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NcanP55066 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NcanP55066 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NcanP55066 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NcanP55066 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcanP55066 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcanP55066 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcanP55066 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcanP55066 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcanP55066 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcanP55066 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NcanP55066 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NcanP55066 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcanP55066 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcanP55066 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcanP55066 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcanP55066 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcanP55066 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcanP55066 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcanP55066 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NcanP55066 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcanP55066 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcanP55066 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcanP55066 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcanP55066 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcanP55066 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcanP55066 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcanP55066 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NcanP55066 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NcanP55066 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NcanP55066 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NcanP55066 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NcanP55066 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NcanP55066 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NcanP55066 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NcanP55066 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NcanP55066 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcanP55066 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcanP55066 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcanP55066 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcanP55066 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NcanP55066 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcanP55066 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcanP55066 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcanP55066 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcanP55066 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcanP55066 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NcanP55066 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NcanP55066 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NcanP55066 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcanP55066 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NcanP55066 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NcanP55066 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcanP55066 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcanP55066 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcanP55066 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NcanP55066 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcanP55066 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NcanP55066 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcanP55066 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcanP55066 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcanP55066 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcanP55066 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcanP55066 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NcanP55066 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NcanP55066 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcanP55066 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcanP55066 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcanP55066 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcanP55066 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcanP55066 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NcanP55066 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NcanP55066 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NcanP55066 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcanP55066 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcanP55066 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NcanP55066 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NcanP55066 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms