Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GemP55041 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GemP55041 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GemP55041 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GemP55041 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GemP55041 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GemP55041 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GemP55041 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GemP55041 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GemP55041 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GemP55041 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GemP55041 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GemP55041 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GemP55041 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GemP55041 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GemP55041 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GemP55041 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GemP55041 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GemP55041 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GemP55041 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GemP55041 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GemP55041 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GemP55041 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GemP55041 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GemP55041 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GemP55041 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GemP55041 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GemP55041 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GemP55041 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GemP55041 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GemP55041 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GemP55041 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GemP55041 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GemP55041 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GemP55041 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GemP55041 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GemP55041 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GemP55041 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GemP55041 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GemP55041 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GemP55041 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GemP55041 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GemP55041 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GemP55041 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GemP55041 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GemP55041 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GemP55041 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GemP55041 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GemP55041 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GemP55041 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GemP55041 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GemP55041 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GemP55041 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GemP55041 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GemP55041 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms