Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fgf9P54130 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgf9P54130 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf9P54130 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms