Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PitpnbP53811 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms