Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PctpP53808 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PctpP53808 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PctpP53808 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PctpP53808 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PctpP53808 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PctpP53808 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PctpP53808 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PctpP53808 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PctpP53808 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PctpP53808 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PctpP53808 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PctpP53808 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PctpP53808 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PctpP53808 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PctpP53808 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PctpP53808 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PctpP53808 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PctpP53808 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PctpP53808 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PctpP53808 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PctpP53808 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PctpP53808 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PctpP53808 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PctpP53808 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PctpP53808 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PctpP53808 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PctpP53808 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PctpP53808 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PctpP53808 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PctpP53808 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PctpP53808 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PctpP53808 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PctpP53808 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PctpP53808 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PctpP53808 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PctpP53808 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PctpP53808 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PctpP53808 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PctpP53808 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PctpP53808 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PctpP53808 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PctpP53808 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PctpP53808 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PctpP53808 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PctpP53808 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PctpP53808 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PctpP53808 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PctpP53808 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PctpP53808 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms