Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fdft1P53798 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fdft1P53798 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms