Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RabggtbP53612 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RabggtbP53612 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RabggtbP53612 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms