Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb1P52795 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms