Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pold1P52431 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pold1P52431 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pold1P52431 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pold1P52431 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pold1P52431 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms